Étude de la dégradation de l’acide désoxyribonucléique par les ultrasons

Centre de Biophysique Moléculaire du CNRS, 45-Orléans-02, France.

Résumé

L’étude de la dégradation de l’acide désoxyribonucléique (DNA) par les ultrasons ne nous a pas permis de mettre en évidence l’existence d’un palier indépendant de la puissance de l’irradiation ultrasonore (7). La valeur de la masse moyenne en poids diminue en fonction du temps d’irradiation et tend vers une valeur limite qui dépend de la puissance acoustique. En fonction du temps de sonication, on observe simultanément une disparition des molécules de constante de sédimentation élevée, l’apparition de molécules de faibles [math] et une diminution de la polydispersité. La double chaîne du DNA est coupée en fragments ayanL conservé intacte la structure en double hélice et ne présentant pas de rupture sur l’une ou l’autre chaîne. La cinétique de dégratation montre que, dans les premières minutes d’irradiation, les ruptures ont lieu simultanément sur les deux chaînes (dégradation « diplotomique »).

Abstract

The study of the ultrasonic degradation of deoxyribonucleic acid (DNA) has not enabled us to evidence the occurence of a plateau, independent of the ultrasonic irradiation intensity (7). The value of the weight average molecular weight decreases as a function of time and tends to a limit depending on the acoustic power. According to the sonication span, simultaneously, were observed a disappearing of molecules with high sedimentation constant, a formation of molecules with low [math] and a decreased polydispersity. The double standed DNA molecule is cleaved into fragments with an intact double-helical structure and no nicks on either chain. A study of the degradation kinetics during the first minutes evidences a pure « diplotomic » cleavage.