Inter- and intramolecular interactions. Inception and refinements of the SIBFA, molecular mechanics (SMM) procedure, a separable, polarizable methodology grounded on ab initio SCF/MP2 computations. Examples of applications to molecular recognition problems

Département de pharmacochimie moléculaire et structurale, Ura D1500 CNRS, U266 Inserm, UFR des sciences pharmaceutiques et biologiques, 4, avenue de l'Observatoire, 75270 Paris cedex 06 France.

Abstract

In this paper we first summarize the distinctive features of the the SIBFA (Sum of Interactions Between Fragments Ab initio computed) molecular mechanics procedure (1-10). An overview of its applications to molecular recognition problems in complexes of biological or pharmacological interest is presented. Recent refinements and enrichments that took place after 1991 are then exposed, along with ongoing applicatons in cadon-ligand, conformadonal analysis, the study of cooperative interactions in multiply hydrogen-bonded oligomers, and the integration with a Continuum reaction field procedure to study solvation.

Résumé

Dans cet article sont d’abord résumés les caractéristiques distinctives de la méthode de mécanique moléculaire SIBFA (Sum of Interactions Between Fragments Ab initio computed, 1-10). Une présentation est ensuite faite de ses applications à des problèmes de reconnaissance moléculaire dans des complexes d’intérêt biologique ou pharmacologique. Des perfectionnements et enrichissements nouveaux, ayant eu lieu à partir de 1991, sont ensuite exposés. Une présentation de certaines applications courantes est faite ensuite, portant sur des complexes mono- et oligoligand de cations métalliques divalents, l’analyse conformationnelle, et l’intégration d’un procédé du Continuum pour l’étude de la solvatation.