Measurement of the Dissociation-Equilibrium Constants for Low Affinity Antibiotic Binding Interaction with Bacterial Ribosomes by the T₂ (CPMG) and Line-Broadening Methods

¹ Université René Descartes-Paris V, Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, UMR 8601 du CNRS, 45 rue des Saint-Pères, 75270 Paris Cedex 06, France
² Université Denis Diderot-Paris VII, UFR Chimie, 2 Place Jussieu, 75251 Paris Cedex 05, France
³ Hoechst Marion Roussel, 102 route de Noisy, 93235 Romainville Cedex, France

Abstract

In this study the dissociation constants of the low antibiotic-ribosomes interaction were determined by the _T2 (CPMG), the Carr-Purcell-Meiboom-Gill spin-echo decay rate and the line-broadening methods. Three MLS_B antibiotics were studied, a macrolide roxithromycin, a ketolide HMR 3647 and a lincosamide clindamycin for their weak interaction with three bacterial ribosomes, E. coli, Staphylococcus aureus sensitive and resistant to erythromycin.

Résumé

Nous avons mesuré la constante de dissociation, Kd correspondant à l'interaction faible antibiotique-ribosome bactérien pour des antibiotiques de différentes classes, un macrolide (roxithromycine), un kétolide (HMR 3647) et une lincosamide (clindamycine) avec des ribosomes de différentes souches bactériennes (E. coli, Staphylococcus aureus sensible ou résistant à l'erythromycin) par deux méthodes : l'une basée sur la variation des largeurs de raies et l'autre sur les temps de relaxation transversaux T₂ en utilisant une séquence CPMG.