The quantitative description of the variation of protein properties and bioactivities with side chain structure

Chemistry Department, School of Liberal Arts and Sciences, Pratt Institute Brooklyn, NY 11205, USA.

Abstract

We have demonstrated the use of the IMF equation in the quantitative description of protein structure, properties, and bioactivities as a function of side chain structure. As examples of the application to structure, properties, and bioactivities we have studied the relative frequency of occurrence of residues in coiled coil; scales for the prediction of residue probability in membranes; and dissociation constants of mutant human growth hormones (hGH) binding to the hGH receptor of human liver. These results illustrate the generality of the method.

Résumé

Nous avons montre le utilisation de la équation IMF dans les descriptions quantitatifs de la structure, propriétés, et bioactivites des proteins a une fonction de la structure des chaînes latérales. Pour les exemples de l’application nous étudions le fréquence relatif du résidus amino acides dans le "coiled coil", les escaliers pour le prédiction de la probabilité d’un résidu dans le membranes, et les constantes de la dissociation de mutations des hormones de le développement humaine lien au récepteur de cette hormone de la foie humaine. Nos résultats illustrions le généralité de la méthode.