Structure and dynamics of the ionophore lasalocid. A multi-computational study. II. Methanol solutions

¹ Laboratoire de chimie physique des solutions (URA CNRS 434), université Blaise-Pascal, 63177 Aubière cedex, France.
² Laboratoire de chimie analytique appliquée, faculté des sciences, Mohamed I, route de Sidi-Maafa, BP 524, Oujda, Maroc.
³ Laboratoire de chimie organique structurale (URA CNRS 485), université Blaise-Pascal, 63177 Aubière cedex, France.

Abstract

A molecular dynamics simulation was performed on lasalocid acid in methanol; it revealed a possible opening-closure process of the molecule and indicated the important role of methanol molecules in this. The results are consistent with those obtained using Monte-Carlo statistical mechanics simulations in methanol and semiempirical quantum calculations in a continuum representative of methanol. Possible conformations of lasalocid in methanol are discussed in relation to data from NMR experiments.

Résumé

Une simulation de dynamique moleculaire du lasalocide acide en solution méthanolique a permis de mettre en évidence un processus possible d’ouverture-fermeture de la molecule et le rôle important des molécules de solvant dans ce processus. Ces résultats sont en accord avec ceux obtenus avec la thermodynamique statistique par échantillonnage de Monte-Carlo et les calculs quantiques semi-empiriques. Les conformations probables du lasalocide dans le méthanol sont confrontées aux données RMN.