Affinement de phases de structures de protéines par l'application de méthodes matricielles via l'espace direct

¹ Chemistry Department, University of York, York, Angleterre.
² Laboratoire de physique, E.R. n° 180, Centre Pharmaceutique, Chatenay Malabry, 92290, France.

Résumé

On développe un nouvel algorithme pour l'affinement de phase, fondé sur une fonction de probabilité dans l'espace direct :

La fonction de densité électronique initiale p_O(r) est multipliée par une fonction de "probabilité de présence atomique" τ(r) pour donner une densité améliorée p₁(r). La fonction τ(r), calculée à partir des éléments de la matrice inverse de Karle-Hauptman, est utilisée dans un processus itératif. Des calculs tests ont été effectués pour l'insuline avec des données expérimentales (F_obs et phases "isomorphes"). Une estimation globale de la méthode est présentée.

Abstract

A novel algorithm for phase refinement is developed, based on probability function in direct space:

The initial electron density function P_O(r) is multiplied by "a probability of atomic presence" function τ(r) to yield an improved density p₁(r). The function τ(r) calculated from the elements of a Karle-Hauptman inverse matrix, is used in an iterative procedure. Test calculations have been performed for insulin with experimental data (F_obs and "isomorphous" phases). An overall estimation for the accuracy of the method is presented.