ACPD ligands for glutamic receptors : conformational analysis by NMR spectroscopy and molecular dynamics. Simulation in water of glutamic acid analogues containing a cyclopentane ring

¹ Université René-Descartes, Paris V, laboratoire de chimie et biochimie pharmacologiques et toxicologiques (URA 400 CNRS), 45, rue des Saints-Pères, 75270 Paris Cedex 06 France.
² Université Denis-Diderot, Paris VII, UFR chimie, 2, place Jussieu, 75251 Paris Cedex 05 France.

Abstract

The conformational analysis of two isomeric glutamic acid analogues cis and trans ACPD containing a cyclopentane ring, was carried out in an aqueous environment, by ^lH and ¹³C NMR spectroscopy, and molecular dynamics (MD) in water. These analogues interact on receptors of central nervous system (receptor metabotropic ACPD for the ligand trans ACPD and receptor ionotropic NMDA for the ligand cis ACPD) . This study show four conformational families I-IV with characteristic distances dl (αNH3⁺ - yCOO^-) and d2 (αCOO^- - YCOO^-).

Résumé

L’analyse conformationnelle de deux analogues de l’acide glutamique cis et trans ACPD contenant un cyclopentane, a été faite par spectroscopie RMN ¹H et ¹³C en solution aqueuse et par Dynamique Moléculaire dans l’eau. Ces analogues interagissent sur des récepteurs du système nerveux central (récepteur métabotropique ACPD pour le ligand trans ACPD et récepteur ionotropique NMDA pour le ligand cis ACPD) . Cette étude montre quatre familles conformationnelles I-IV avec des distances caractéristiques dl (αNH3⁺ - yCOO^-) et d2 (αCOO^- - yCOO^-) .