A 2D J-δ selective INEPT experiment using DANTE pulse train for determination of sugar units orientation in macrolide antibiotics

¹ Université René-Descartes, Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, CNRS, URA 400, 45, rue des Saints-Pères, F-75270 Paris Cedex 06, France ;
² Unité mixte Bruker, CNRS Université Louis-Pasteur, Bruker Spectrospin ; Laboratoire d’applications, 67160 Wissembourg et Institut Le Bel, 67000 Strasbourg, France.

Abstract

Measurement of the long-range ¹³C-¹H coupling constants is performed using 2D J-δ selective INEPT experiment on macrolide antibiotics, erythromycin A, roxithromycin, and their metabolites, erythralosamine and RU 39001 respectively.

The 2D J-δ selective INEPT experiment is performed assuming selective excitation by a DANTE pulse train. Dihedral angle values for the glycosidic bonds are deduced from a Karplus type equation for conformational study. Eventual equilibria between different conformers are considered from comparison between experimental results and theoretical calculations by Molecular Dynamics.

Résumé

La mesure de constantes de couplage longue distance ¹³C-¹H est réalisée à l’aide d’expériences 2D J-δ INEPT sélectives pour les antibiotiques macrolides érythromycine A, roxithromycine, et leurs métabolites respectifs érythralosamine et RU 39001. Les expériences 2D J-δ INEPT sélectives sont effectuées à l’aide d’excitations sélectives par train de puises de type DANTE. Les valeurs des angles dièdres pour les liaisons glycosidiques sont déduites d’une équation de type Karplus pour une étude conformationnelle. Les éventuels équilibres entre différents conformères sont envisagés à partir de la comparaison entre les résultats expérimentaux et des calculs théoriques de dynamique moléculaire.