Étude expérimentale de l’auto-association des molécules modèles dipeptidiques

I. — Dipeptides dérivés de la glycine et de la L-alanine

¹ (Laboratoire de Chimie Physique Macromoléculaire, ERA CNRS n° 23, ENSIC, INPL, 1, rue Grandville, 54042 Nancy Cedex), France.
² (Laboratoire de Minéralogie et Cristallographie, ERA CNRS n° 162, Université de Nancy I, Case Officielle n° 140, 54037 Nancy Cedex.), France.

Résumé

Les modes et les degrés d’association des dipeptides de formule générale

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dérivant de la glycine (R₂ = H) et de la L-alanine (R₂ = CH₃), et placés en solution dans le tétrachlorure de carbone, ont été examinés par spectroscopie infrarouge et résonance magnétique nucléaire.

Par concentration progressive des solutions, l’équilibre entre les conformères C₅ et C₇ décrit dans le cas des solutions diluées est déplacé au profit des conformères C₅ qui dimérisent par formation de deux liaisons hydrogène H₃ . . . O₁ symétriques. L'agrégation des dipeptides de la L-alanine ne se poursuit pas au delà du stade dimère. Il en est de même pour un dipeptide de la glycine portant deux groupements terminaux R₁ et R₃ très volumineux. Au contraire, si l’un des groupes R₁ ou R₃ est relativement moins encombrant, les dimères cycliques précédents s’associent par les sites H₂ et O₂ sans déformation notable des conformères C₅.

Ces types d’agrégation sont comparés aux modes d’empilement des molécules dans les structures cristallines des dipeptides correspondants.

Abstract

Aggregation modes of glycine and L-alanine containing dipeptides have been investigated by using infrared spectro- scopy and proton magnetic resonance. Experiments were carried out carbon tetrachloride solutions of compounds withe the general formula

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When increasing concentration, the equilibrium between C₅ and C₇ conformers previously characterized in dilute solutions is shifted toward the C₅ ones which dimerize by means of two intermolecular and symmetrical H₃ ... O₁ hydrogen bondings. Association does not seem to go beyond the dimer stage in the case of L-alanine derivatives. The same is true for one glycine derivation in which both end groups R₁ and R₃ are bulky substituents. On the contrary, if one of the end groups R₁ or R₃ is somewhat less bulky, the cyclic dimer associates by means of H₂ ... O₂ hydrogen bonding without a noticeable distorision of the C₅ conformers.