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J. Chim. Phys.
Volume 92, 1995
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Page(s) | 1773 - 1776 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/jcp/1995921773 | |
Published online | 29 May 2017 |
Preliminary study of substrate binding to thymidine kinase by transferred NOE
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Laboratoire de pharmacologie et de toxicologie fondamentales, CNRS, 118, route de Narbonne, 31062 Toulouse, France.
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ETH Zürich, Departement Pharmazie, Winterthurerstr 190, CH-8057 Zürich, Switzerland.
A series of substrates with different values of dissociation constants Kd characteristic of their interaction with thymidine kinase (TK) has been studied (thymidine, acyclovir and tricycle). In thymidine-TK solutions no transferred NOEs were observed which was attributed to the fact that the dissociation constant Kd is too low (~8 µm). In both acyclovir and tricycle, however, Kd proved sufficiently high (~400 µM) to allow for the observation of negative (transferred) NOEs. Series of NOESY spectra were recorded for tricycle (positive NOEs) and for the tricycle-TK complex (negative NOEs). The NOE pattern remains the same in both cases which indicates that the structure of the ligand does not change significantly upon binding to TK. The analysis of correlation patterns proves that the orientation of the aliphatic chain of tricycle with respect to the aromatic rings is characteristic of the syn conformation.
Résumé
Une série de substrats qui interagissent avec TK et dont les constantes de dissociation Kd sont différentes, a été étudiée (thymidine, acyclovir, tricycle). On n’a pas observé de NOE transféré (TRNOE) dans les solutions de thymidine et TK, ce qui peut s’expliquer par la valeur de la constante de dissociation trop faible (~8 µm). Par contre, dans les solutions d’acyclovir et de tricycle le Kd était suffisamment élevé (~400 µM) pour permettre l’observation de NOE négatif (transféré). Nous avons obtenu les spectres NOESY pour tricycle (NOEs positives) et pour le complexe tricycle-TK (NOEs négatives). Dans ces deux cas les cartes de NOE étaient les mêmes, ce qui nous indique que la structure du ligand ne change pas de façon significative quand il se lie au TK. L’analyse des corrélations spectrales montre que l’orientation de la chaîne aliphatique par rapport aux cycles aromatiques est caractérisée par la conformation de type syn.
Key words: tricycle / thymidine kinase / transferred NOE / NMR
© Elsevier, Paris, 1995